Филогенетска анализа вируса афричке куге свиња у Србији

Abstract

Од када се 2007. године појавила у Грузији, афричка куга свиња се прогресивно шири ка западу, али и на исток, стижући чак до острвске државе Тимор-Лесте. Упркос многим превентивним мерама, афричка куга свиња се у Србији по први пут појавила у јулу 2019. године у општини Младеновац код домаћих свиња. Након примарног избијања, забележен је још један изолован случај код домаћих свиња у 2019. у општини Житиште. С почетком 2020. откривени су први случајеви обољења код дивљих свиња, у пиротском и борском округу. Иако сви вируси који циркулишу у Евро-Азији воде порекло од истог претка, промене на геному настале услед еволутивних процеса, се детектују веома спорадично. Генотипизација 10 сојева вируса који су довели до обољења код дивљих и домаћих свиња у Србији извршена је на основу p72 гена. Поред тога, извршена је подтипизација на основу нуклеотидних секвенци централног варијабилног, IGRI73R-I329L и MGF региона. Утврђено је да свих десет сојева припада генотипу II, при чему су секвенце p72 гена 100% идентичне са изолатима из централне и источне Европе. Такође, утврђени подтипови, GII-CVR1, GIIIGRI73R-I329L-2 и GII-MGF -1, су заједнички у већини ЕУ земаља.

Since its emergence in Georgia in 2007, African swine fever has been progressively spreading westward as well as eastward, reaching even the island state of Timor- Leste. Despite many preventative measures, the African swine fever in Serbia first appeared in July 2019 in the municipality of Mladenovac in domestic pigs. Following the primary outbreak, another isolated case in domestic pigs in 2019 in Žitište municipality was recorded. In early 2020, the first cases of wild boar disease were detected in the Pirot and Bor districts. Although all viruses circulating in Euro-Asia originate from the same ancestor, changes in the genome resulting from evolutionary processes are detected very sporadically. Genotyping of 10 viral strains that caused the disease in wild and domestic pigs in Serbia was performed based on p72 gene sequences. In addition, subtyping was performed based on nucleotide sequences of the central variable, IGRI73R-I329L and MGF regions. All ten strains were found to belong to genotype II, having the p72 gene sequences 100% homologous to isolates from central and Eastern Europe. Also, identified subtypes, GII-CVR1, GIIIGRI73RI329L- 2 and GII-MGF -1, are common in most EU countries.